Она началась в 30-х годах ХХ столетия. Транспорт преимущественно был гужевым. Зафиксирован случай своеобразного рекорда. Мерин по кличке Мальчик провез груз весом в пять тонн от речного порта до Ветки Чола.

Дальнейшее развитие транспорта связано со строительством в городе череповецкого металлургического завода. Для строителей ЧМЗ было выделено несколько грузовых автомобилей, оборудованных фургонами. В народе их называли шарабаны.

В первой половине 1950-х годов было создано автотранспортное предприятие, в состав которого входил не только автомобильный, но и гужевой транспорт. Управление занималось как пассажирскими, так и грузовыми перевозками. В середине 1950-х гг. в Череповец стали поступать автобусы марки ЛИАЗ.

В 1962 году автотранспортное предприятие было разделено на две автоколонны:

В 1970-е годы автоколонны насчитывали до 300 единиц транспорта каждая.

19 октября 1956 года в городе состоялся пуск первого трамвая. Была открыта линия Завод - Фабрика обуви, которая соединила жилую часть города с ЧМЗ. В мае 1958 года открыта линия Завод-вокзал. В 1979 году, после большой подготовительной работы был проложен маршрут, соединивший трамвайными путями Зареченскую часть с центром города.

В 1980-е годы в Череповце на маршруты выходило 165 автобусов и 37 трамваев.
С конца 1980-х годов положение дел на череповецком автомобильном транспорте резко ухудшается, перевозки пассажиров стали убыточными. Причина - сильная изношенность подвижного состава. Значительная часть автобусов находилась в ремонте. Средств же на покупку нового транспорта не было. 97 старых автобусов, которые выходили на линии, не могли обеспечить нормальную перевозку пассажиров.

В 1992 году состоялась забастовка водителей автоколонны 1456, которые требовали повышения заработной платы. Забастовка показала опасность монополии на автотранспорте. У администрации города возникла идея создания альтернативного предприятия.
В декабре 1993 года было образовано Муниципальное предприятие Череповецкое пассажирское автотранспортное предприятие (МП ЧПАТП). Автобусы для предприятия удалось купить за счет кредита, выделенного Центром занятости населения. Администрация города разрешила новому предприятию в течение двух лет работать по наиболее оптимальному графику (с 7 до 19 часов). Плата за проезд в автобусах МП ЧПТАП была выше, нежели на а/к 1456, пассажирам не предоставлялось льгот. Кроме того, на маршрутах МП ЧПАТП стали работать кондукторы, собирающие плату за проезд.

Появление нового автотранспортного предприятия значительно улучшило ситуацию с пассажирским транспортом.

С 1996 года изменилось положение и в автоколонне 1456. Администрации города удалось получить целевой заем у Мирового Банка реконструкции и развития, который был направлен на приобретение новых автобусов, оборудования и запасных частей. Все автобусы были переданы автоколонне 1456.

В начале 1997 года в Череповце было образовано первое частное автотранспортное предприятие, занимающееся перевозками на территории города ООО «Новотранс».

В настоящее время в городе действуют:

Кроме того, перевозками пассажиров занимаются таксомоторные предприятия.

Сегодня на городских маршрутах работает ежедневно до 400 автобусов. Подавляющее большинство из них принадлежат частным предпринимателям.

Контроль за работой автобусов на маршрутах проводится с помощью спутниковых навигационных систем. Благодаря этой системе, диспетчер сможет видеть любой автобус на своем мониторе, а водитель имеет постоянную связь с автопарком. Любая нестандартная ситуация сможет сразу получить решение.

По оценкам специалистов Всероссийского Фонда Института экономики города, транспортный комплекс города Череповца является, на сегодняшний день, одним из лучших в Российской Федерации.